Welcome to Chinese Journal of Tropical Crops,
Crop Pests, Diseases and Their Control, Environmental Protection

Optimization of Fermentation Conditions of Antagonistic Actinomycetes FS-4

  • DUAN Yajie 1 ,
  • MEI Zhigang 2 ,
  • SUN Dequan 1 ,
  • LI Weiming 1 ,
  • PANG Zhencai 1 ,
  • HU Huigang , 1, *
Expand
  • 1. South Asia Tropical Crops Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agriculture Sciences / Key Laboratory of Tropical Fruit’s Biology, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Zhanjiang, Guangdong 524091, China
  • 2. School of Mechanical and Power Engineering, Guangdong Ocean University, Zhanjiang, Guangdong 524088, China
* HU huigang,E-mail:

Received date: 2019-04-02

  Request revised date: 2019-07-31

  Online published: 2020-03-21

Copyright

Copyright reserved © 2020. Office of Acta Agronomica Sinica All articles published represent the opinions of the authors, and do not reflect the official policy of the Chinese Medical Association or the Editorial Board, unless this is clearly specified.

Abstract

The screening of antagonistic bacteria from soil microorganisms in the areas with banana Fusarium wilt is of great practical significance for controlling this disease. In this report, a strain, designated FS-4, was isolated from healthy banana rhizosphere soil in the area affected by Fusarium wilt. Based on Gause’s No. 1 synthetic medium, the optimization of medium, single factor experiments and response surface experiments were conducted to maximize the production of the antibacterial substances of actinomycete FS-4. The best fermentation medium and fermentation conditions were as follows: sucrose 2.4%, peptone 0.5%, K2HPO4 0.05%, NaCl 0.05%, MgSO4 0.05%, fermentation temperature 28 ℃, initial pH 7. Under the conditions, the inhibition zone diameter of actinomycete FS-4 fermentation filtrate reached 27.1 mm on the test plates of Bacillus subtilis after 62 h incubation

Cite this article

DUAN Yajie , MEI Zhigang , SUN Dequan , LI Weiming , PANG Zhencai , HU Huigang . Optimization of Fermentation Conditions of Antagonistic Actinomycetes FS-4[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2020 , 41(2) : 339 -345 . DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2020.02.018

由尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum f. sp. cubense)侵染引起的枯萎病是香蕉种植中的毁灭性病害,对相关产业的健康发展具有重要影响[1]。抗病育种、化学农药、轮作等方法在对香蕉枯萎病的防治中均存在不同的缺陷,难以规模化推广应用。利用包括拮抗微生物在内的生物防治方法具有安全、环保、经济效益高等优点,是当前该类病害防治研究中的热点[2]。FS-4是本团队从香蕉枯萎病发病田土壤中分离筛选出的1株放线菌,其对香蕉枯萎病菌具有较好拮抗作用[3,4]
本团队采用16S rDNA 序列分析其放线菌为曼尼普尔链霉菌(Streptomyces manipurensis),命名为曼尼普尔链霉菌FS-4(Streptomyces manipurensis FS-4)[3,4]。采用国际链霉菌规划中的标准培养基(1976),28 ℃培养7~21 d,观察FS-4菌株培养特征。结果发现:FS-4菌株能使硝酸盐还原,淀粉水解,能产生H2S、黑色素、尿素酶和酪氨酸酶,但不能使明胶液化、牛奶胨化与凝固。生长pH范围为5.0~10.0,最适生长pH为7.0。最适生长温度为28~32 ℃,不能生长在NaCl含量大于3%的培养基。FS-4菌株对香蕉枯萎病1号(Foc 1)和4号(Foc 4)小种均有拮抗作用,对香蕉枯萎病菌1号小种的拮抗性较弱,显著低于香蕉枯萎病菌4号小种,2者的抑菌带宽度分别为12.07和15.12 mm。
菌株FS-4在人工培养条件下生长缓慢,制约了相关研究工作的进行。响应面分析法通过研究响应输出结果与影响因子之间的数学关联模式,经由设计者在所关心的试验区域内以系统的方式进行试验,最终得到所设想的响应值和影响因子变化趋势,是一类包含了数学应用、统计处理和试验设计的分析工具[5],近年来在微生物发酵工艺研究中得到广泛应用。为更好地开展FS-4拮抗作用机理及其田间应用研究,本研究采用响应面分析法开展FS-4菌株的发酵工艺筛选研究。

1 材料与方法

1.1 材料

拮抗放线菌菌株FS-4和香蕉枯萎病菌菌株Foc 4由中国热带农业科学院南亚热带作物研究所提供。高氏1号培养基和营养肉汤培养基参照王小琴等[6]的方法制备,相关试剂均为国产分析纯。

1.2 方法

1.2.1 菌株发酵和拮抗活性评价 参照段雅婕等[3]和柯春亮等[4]的方法进行。
1.2.2 液体发酵培养基及发酵条件的单因素分析[7-11] 以高氏1号培养基为基础,分别以不同碳源(葡萄糖、蔗糖、玉米粉、乳糖)代替基础培养基中的碳源(可溶性淀粉)。制备无菌发酵滤液后,采用牛津杯法评价拮抗物质活性。获得最佳碳源后,将含量调整为1%、2%、3%、4%和5%,筛选出最佳含量。在明确最佳碳源及其含量后,以0.1%的硫酸铵、硝酸钠、酵母粉、蛋白胨代替原基础培养基中硝酸钾,筛选出最佳氮源。将最佳氮源含量调整为0.1%、0.2%、0.3%、0.4%、0.5%,确定最佳含量。
将氯化钠、磷酸氢二钾和硫酸镁含量分别调为0.025%、0.050%、0.075%、0.100%、0.125%,筛选出最佳含量。设置培养基初始pH为 5、6、7、8和9,发酵温度为22、25、28、31和34 ℃,发酵时间为48、72、96、120和144 h,分别筛选出最佳参数。
1.2.3 响应面分析法优化发酵培养基及发酵条件 在单因素实验的基础上,选取蔗糖、蛋白胨、时间作为考察因素,以抑菌圈大小为响应值,采用3因素3水平对放线菌FS-4最佳发酵条件进行响应面分析(表1[12]
表1 Box-Behnken实验因素水平表

Tab. 1 Box-Behnken experimental for factor and level

因素Factor 水平Level
-1 0 1
A蛋白胨/% 0.3 0.4 0.5
B蔗糖/% 1 2 3
C时间/h 24 48 72

1.3 数据处理

利用Design-Expert软件进行3因素3水平的Box-Behnken实验设计。所有实验均为3次重复,使用SPSS19.0软件进行统计学方差分析。

2 结果与分析

2.1 单因素实验结果

2.1.1 碳源种类及含量对放线菌FS-4产抑菌物质的影响 以高氏一号培养基为基础进行碳源的优化[13],分别以蔗糖、乳糖、玉米粉、葡萄糖、可溶性淀粉作为碳源。结果表明,以蔗糖为碳源的培养基,发酵液的抑菌圈直径最大达到20.5 mm,表明蔗糖最有利于放线菌FS-4产生抑菌物质(图1)。在对蔗糖5个不同浓度处理的评价中,发现含量为2%时,发酵液产生的抑菌物质活性最强(图2)。
图1 碳源对FS-4菌株产生抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平。

Fig. 1 Effect of carbon sources on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

Difference lowercase letters represent 5% significant level.

图2 蔗糖浓度对FS-4菌株产生抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平。

Fig. 2 Effect of sucrose concentration on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

Difference lowercase letters represent 5% significant level.

2.1.2 氮源种类及浓度对放线菌FS-4产抑菌物质的影响 以高氏1号培养基为基础,进行了5种氮源的筛选[14,15]。以蛋白胨为碳源时,抑菌圈直径最大,效果最好(图3),而且当蛋白胨含量为0.4%时,发酵液的抑菌物质活性最高(图4)。
图3 氮源对FS-4菌株产抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平。

Fig. 3 Effect of nitrogen sources on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

Different lowercase letters represent 5% significant level.

图4 氮源含量对FS-4菌株产抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平。

Fig. 4 Effect of nitrogen sources concentration on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

Difference lowercase letters represent 5% significant level.

2.1.3 氯化钠、磷酸氢二钾、硫酸镁含量对放线菌FS-4产抑菌物质的影响 在高氏1号培养基的基础上进行了无机盐浓度的优化,结果表明,3种无机盐的不同浓度对放线菌FS-4抑菌物质的活性影响不大(图5)。
图5 氯化钠、磷酸氢二钾、硫酸镁对FS-4菌株产生抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平。

Fig. 5 Effect of sodium chloride, dipotassium hydrogen phosphate and magnesium sulfate concentration on activity of antimicrobial substance produced by fS-4

Difference lowercase letters represent 5% significant level.

2.1.4 初始pH、发酵温度、时间对放线菌FS-4产抑菌物质的影响 图中抑菌圈的直径反映发酵液中抑菌物质的活性。筛选结果表明,初始pH在6~8、发酵温度在22~31 ℃范围内,无菌发酵液拮抗物质活性活性最高,而48 h为发酵最适时间(图6,图7图8)。
图6 pH对FS-4菌株产生抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平

Fig.6 Effect of pH on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

Difference lowercase letters represent 5% significant level.

图7 温度对FS-4菌株产生抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平。

Fig. 7 Effect of temperature on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

Difference lowercase letters represent 5% significant level.

图8 发酵时间对FS-4菌株产生抑菌物质的影响

不同小写字母表示差异分析达到5%显著水平。

Fig. 8 Effect of fermentation time on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

Difference lowercase letters represent 5% significant level.

2.2 响应面优化结果及分析

2.2.1 响应面结果 如表2所示,本研究对17个实验点进行分析。其中,12个点是析因点,5个点(实验号分别为1、5、8、10和17)用于计算实验误差的中心实验点。
表2 响应面结果表

Tab. 2 Response surface design experimental results

实验号
Experiment
number
A B C 抑菌圈直径
Inhibition zone
diameter/mm
1 0 0 0 25.4
2 1 0 -1 21.9
3 0 1 -1 20.9
4 -1 -1 0 21.4
5 0 0 0 24.9
6 -1 1 0 22.9
7 -1 0 1 21.4
8 0 0 0 25.4
9 1 -1 0 26.4
10 0 0 0 25.9
11 0 1 1 25.4
12 1 0 1 26.4
13 0 -1 1 24.4
14 1 1 0 26.9
15 0 -1 -1 21.4
16 -1 0 -1 20.4
17 0 0 0 26.7
2.2.2 模型建立与方差分析 对响应面的结果进行多元回归拟合[16],得出抑菌圈直径为Y与蛋白胨浓度、蔗糖浓度、时间的二次多项回归方程为:
Y=25.26+1.94A+0.31B+1.63C–0.25AB+0.88AC+0.38BC–0.88A2–0.38B2–2.26C2
对回归方程模型进行方差分析,结果如表3所示。回归方程模型极显著,表明模型建立可信。模型的决定系数为0.9604,表明3.96%的实验数据不适合预测模型。模型的校正系数为0.9094,说明模型拟合程度良好,只有9.06%的实验数据的变异性不能解释。失拟项的P值是0.4386,不具有统计学差异,说明模型不需要引入更高次数的项。一次项A和C,二次项C2都达到极显著水平,交互项AC,二次项A2都达到显著水平。还可以得知3个因素对抑菌圈直径大小的影响顺序为:蛋白胨>蔗糖>时间。
2.2.3 响应面的分析与优化[17,18] 根据建立的回归模型得到响应曲面图(图9)。当时间一定时,抑菌圈的直径随着蛋白胨和蔗糖含量的增加而变大,蛋白胨比蔗糖对抑菌圈直径影响更大,两者的交互作用不明显。蔗糖含量在2.50%~3.00%,蛋白胨含量在0.45%~0.50%范围内,抑菌圈的直径达到最大(图9)。
表3 模型的方差分析

Tab. 3 ANOVA for model analysis of variance

方差来源
Sources of variation
平方和
Quadratic sum
自由度
Freedom
均方
Mean square
F
F value
P 显著性
Conspicuousness
模型 82.73 9 9.19 18.85 0.0004 **
A蛋白胨 30.03 1 30.03 61.57 0.0001 **
B蔗糖 0.78 1 0.78 1.60 0.2462
C时间 21.13 1 21.13 43.31 0.0003 **
AB 0.25 1 0.25 0.51 0.4972
AC 3.06 1 3.06 6.28 0.0407 *
BC 0.56 1 0.56 1.15 0.3185
A2 3.26 1 3.26 6.68 0.0362 *
B2 0.61 1 0.61 1.25 0.3011
C2 21.41 1 21.41 43.89 0.0003 **
残差 3.41 7 0.49
失拟项 1.56 3 0.52 1.12 0.4386
纯误差 1.85 4 0.46
总和 86.15 16

Note: ** was extremely significant (P< 0.01); * was significant (P< 0.05); not significant (P > 0.05). R2=0.9604; R2adj=0.9094.

注:**为极显著(P值<0.01);*为显著(P值<0.05);不显著(P值>0.05);R2=0.9604;R2adj=0.9094。

图9 蛋白质和蔗糖含量对放线菌FS-4产抑菌物质的影响

Fig. 9 Effect of protein and sucrose content on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

当蔗糖含量和时间一定时,抑菌圈的直径与蛋白胨含量成正相关,而蔗糖和蛋白胨含量一定时,抑菌圈的直径随着时间的延长先增大后减小,两者交互作用明显。时间在56~64 h内,蛋白胨含量在0.45%~0.50%范围内,抑菌圈的直径达到最大(图10)。
图10 蛋白质含量和时间对放线菌FS-4产抑菌物质的影响

Fig. 10 Effect of protein content and time on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

当蛋白胨含量和时间一定时,抑菌圈的直径与蔗糖含量成正相关,但增长趋势较缓。当蔗糖和蛋白胨含量一定时,抑菌圈的直径随着时间的延长先增大后减小,说明超过一定发酵时间后,发酵液中抑菌物质活性会降低,且蔗糖和蛋白胨交互作用不明显。时间在56~64 h内,蛋白胨含量在2.50%~3.00%范围内,抑菌圈的直径达到最大(图11)。
图11 蔗糖含量和时间对放线菌FS-4产抑菌物质的影响

Fig. 11 Effect of sucrose content and time on activity of antimicrobial substance produced by FS-4

2.2.4 放线菌FS-4发酵培养基及发酵条件的优化和可靠性验证 通过Design-Expert V8.0.6软件分析得到最佳条件为:蛋白胨含量0.5%,蔗糖2.37%,时间62.04 h。在此条件下,抑菌圈的理论直径为27.46 mm。为简化实验操作,将条件修正为蛋白胨浓度0.5%,蔗糖浓度2.4%,时间62 h。实际得到抑菌圈直径27.1 mm,与预测理论值相近。因此,得出的最佳条件具有较好的实用价值。

3 讨论

抗菌活性物质通常作为拮抗放线菌发挥生物防治作用的物质基础,其产量的高低影响着抑菌的实际效果[15, 19]。发酵是获得大量微生物活性代谢产物的基础,微生物代谢产物的类型和产量与其培养条件,如培养基中的碳源、氮源、pH等密切相关[20,21],因此,探索出适宜的培养条件尤为关键。研究表明,不同培养基配方对菌株抑菌活性有较大影响[22,23]。程沁园等[24]研究的放线菌菌株WB-F以葡萄糖为碳源,黄豆粉为氮源时,单体积发酵液抑菌直径提高了23.1%。朱宏建等[25]发现的放线菌菌株ND045在碳源为蔗糖、氮源为大豆粉时,菌株发酵滤液对辣椒尖孢炭疽病菌(Colletotrichum acutata)的抑菌率为35.2%。另外,发酵时间对放线菌FS-4产抑菌物质也会产生影响。在本研究中,由图8可知24 h的发酵液里已有抑菌物质,当发酵48 h后,抑菌圈直径不再增加,说明放线菌FS-4基本停止产生抑菌物质或者抑菌物质的活性下降。
发酵工艺中的每一步、每个环节都至关重要。传统的正交试验设计、全因子试验设计等手段优化微生物发酵工艺,实验工作量较大,结果也不全面。而响应面法能很好地对影响发酵工艺过程中的培养基、培养条件等进行优化和评价[26]。本研究采用响应面实验进行发酵条件的优化,与优化前相比,菌株FS-4抑菌直径增加了26.1%。不同发酵条件对菌株发酵液抑菌活性有一定影响。本研究得到菌株FS-4最优发酵条件为:蛋白胨0.5%,蔗糖2.4%,时间62 h,发酵温度28 ℃,发酵pH为7,磷酸氢二钾、氯化钠和硫酸镁为0.05%。这与莫坤联[27]从抗香蕉枯萎病菌放线菌BWL58及BWL15-4菌株的最优发酵条件存在一定差异,其原因可能是不同菌株对于发酵过程中各理化因素需求不同的表现,也可能是生理代谢途径因菌种差异的体现。
微生物发酵是个动态的生物学过程,培养基中各养分含量、pH、容氧量和产物量一直处于不断变化,不同因素的变化会对发酵产物的种类和产量均有较大的影响[27]。本研究仅考虑了发酵前的培养基状态和培养条件,未对发酵过程各因素进行动态监控,在后续的研究中,应采用生物化学分子生物学等方法对目标菌株的代谢动态过程进行深入研究,探讨培养基的各养分含量与目标活性物质产量及培养条件之间的关系,进而提高目标活性物质的产率。
[1]
Shen Z, Ruan Y, Chao X , et a1. Rhizosphere microbial community manipulated by 2 years of consecutive biofertilizer application associated with banana Fusarium wilt disease suppression[J]. Biology and Fertility of Soils, 2015,51(5):553-562.

[2]
Guo L, Yang L, Liang C , et a1. The G-protein subunits FGA2 and FGB1 play distinct roles in development and pathogenicity in the banana fungal pathogen Fusarium oxysporum f. sp cubense[J]. Physiological and Molecular Plant Pathology, 2016,93:29-38.

[3]
段雅婕, 陈晶晶, 周登博 , 等. 豆粕有机质发酵液中香蕉枯萎病拮抗菌的筛选与鉴定[J]. 江苏农业科学, 2015,43(12):168-171.

[4]
柯春亮, 陈宇丰, 周登博 , 等. 香蕉根际土壤解磷细菌的筛选、鉴定及解磷能力[J]. 微生物学通报, 2015,42(6):1032-1042.

[5]
袁辉林, 康丽华, 马海滨 . 响应曲面法及其在微生物发酵工艺优化中的应用[J]. 安徽农业科学, 2011,39(16):9498-9500, 9502.

[6]
王小琴, 龚斌, 朱薇玲 , 等. 放线菌327#的发酵培养基筛选及培养条件优化[J]. 中国酿造, 2010(10):47-50.

[7]
段雅婕, 庞振才, 陈晶晶 , 等. 二氧化氯对土壤中香蕉枯萎病的防治效果初探[J]. 中国南方果树, 2015,44(6):74-77, 81.

[8]
牛世全, 耿晖, 阎薇如 , 等. 黄芪根腐病生防放线菌筛选鉴定及其优化培养[J]. 植物保护学报, 2016,43(6):943-950.

[9]
田雪莲, 尹显慧, 龙友华 , 等. 猕猴桃溃疡病菌拮抗菌筛选、鉴定及发酵条件优化[J]. 食品科学, 2017,38(16):79-85.

[10]
冯沛仙, 张仁文, 夏占峰 , 等. 响应面法优化易变链霉菌Streptomyces mutabilis TRM45540产放线菌素D的发酵条件[J]. 中国抗生素杂志, 2016,41(6):435-440.

[11]
梁金钟, 王翼雪, 梅剑秋 . 植物乳杆菌富硒培养条件的优化[J]. 食品工业科技, 2017,38(3):137-142.

[12]
Shakeel Q, Lyu A, Zhang J , et a1. Optimization of the cultural medium and conditions for production of antifungal substances by Streptomyces platensis 3-10 and evaluation of its efficacy in suppression of clubroot disease (Plasmodiophora brassicae) of oilseed rape[J]. Biological Control, 2016,101:59-68.

[13]
Zhao Z Y, Ma S S, Li A , et a1. Effects of trophic modes, carbon sources, and salinity on the cell growth and lipid accumulation of tropic ocean oilgae strain Desmodesmus sp. WC08[J]. Applied Biochemistry and Biotechnology, 2016,180(3):452-463.

[14]
Bi F, Ment D. Luria N , et a1. Mutation of AREA affects growth, sporulation, nitrogen regulation, and pathogenicity in Colletorichum gloeosporioides[J]. Fungal Genetics and Biology, 2017,99:29-39.

[15]
石怀兴 . 枯草芽孢杆菌G8发酵条件的优化、抗菌物质的部分特性分析及分离纯化[D]. 济南: 山东农业大学, 2009.

[16]
陈美花, 程雪冰, 黄海 , 等. 乳清分离蛋白对鲜榨黄冠梨汁澄清效果的研究[J]. 食品工业科技, 2017,38(3):186-191.

[17]
马新辉, 李镕廷, 赵晓涵 , 等. 双水相体系萃取蓝莓多糖的分配平衡研究[J]. 食品工业科技, 2017,38(3):211-214, 220.

[18]
张莉力, 许云贺, 肖海蒂 , 等. 地衣芽孢杆菌BL-5产孢发酵条件优化[J]. 食品工业科技, 2017,38(3):150-155.

[19]
Shen Z, Ruan Y, Chao X , et a1. Rhizosphere microbial community manipulated by 2 years of consecutive biofertilizer application associated with banana Fusarium wilt disease suppression[J]. Biology and Fertility of Soils, 2015,51(5):553-562.

[20]
Karangwa P, Blomme G, Beed F , et a1. The distribution and incidence of banana Fusarium wilt in subsistence farming systems in east and central Africa[J]. Crop Protection, 2016,84:132-140.

[21]
Sharma P, Kalita M C, Thakur D . Broad spectrum antimicrobial activity of forest-derived soil Actinomycete, Nocardia sp PB-52[J]. Front Microbiology, 2016,7:347.

[22]
Gurovic MSV, Olivera NL . Antibacterial producing actinomycetes from Extra Andean Patagonia[J]. Journal of Arid Environments, 2017,144:216-219.

[23]
王彦, 牛世全, 郑豆豆 , 等. 黄瓜枯萎病拮抗放线菌的筛选、鉴定及发酵条件优化[J]. 微生物学通报, 2019,46(5):1062-1073.

[24]
程沁园, 叶亮, 邢莹莹 , 等. 海洋放线菌WB-F5 发酵条件的优化及抑菌活性产物性质的初步研究[J]. 中国天然药物, 2007,5(2):142-145.

[25]
朱宏建, 欧阳小燕, 周倩 , 等. 一株辣椒尖孢炭疽病菌拮抗菌株的分离鉴定与发酵条件优化[J]. 植物病理学报, 2012,42(4):418-424.

[26]
袁辉林, 康丽华, 马海滨 . 响应曲面法及其在微生物发酵工艺优化中的应用[J]. 安徽农业科学, 2011,39(16):9498-9500, 9502.

[27]
莫坤联 . 抗香蕉枯萎病菌链霉菌菌剂制备及其防效测定[D]. 海口: 海南大学, 2012.

Outlines

/