1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
表1 引物序列信息Tab. 1 Sequences information of primers |
| 引物名称 Primer ID | 引物序列(5°-3°) Primer sequences (5°-3°) | 引物用途 Primer purpose |
|---|---|---|
| T18 | TTTTTTTTTTTTTTTTTT | 逆转录 |
| qSEP3-1u | GCTGGATCAGCTTATGGAGT | MiSEP3-1 qRT-PCR |
| qSEP3-1d | GCACTCACTGCTGTTATTTG | |
| qSEP3-2u | GCTGGATCAGCTTATGGATC | MiSEP3-2 qRT-PCR |
| qSEP3-2d | GCACTTACTGCTGTTATTGC | |
| qActin1u | CCGAGACATGAAGGAGAAGC | qRT-PCR内参基因 |
| qActin1d | GTGGTCTCATGGATACCAGCA |
2 结果与分析
2.1 芒果MiSEP3基因的序列分析
图1 MiSEP3s基因外显子-内含子结构黑色框代表外显子,线条代表内含子。 Fig. 1 Exon-intron structure of MiSEP3s The black boxes represent exons and the lines represent introns. |
2.2 芒果 MiSEP3蛋白同源性及进化树分析
2.3 芒果MiSEP3基因启动子序列分析
图4 芒果MiSEP3-1和MiSEP3-2启动子序列同源性对比Fig. 4 Homology comparison of MiSEP3-1 and MiSEP3-2 promoter sequences in mango |
表2 两个MiSEP3s基因启动子主要顺式作用元件比较分析Tab. 2 Comparative analysis of cis elements of two MiSEP3s gene promoters |
| 元件类型 Element types | 元件名称 Element name | 序列 Sequence | MiSEP3-1 元件数量 Element number of MiSEP3-1 | MiSEP3-2 元件数量 Eelement number of MiSEP3-2 | 功能 Function |
|---|---|---|---|---|---|
| 光响应性元件 | GT1CONSENSUS | GRWAAW | 6 | 10 | 光调控基因结合位点 |
| SORLIP1AT | GCCAC | 2 | 0 | 光诱导元件 | |
| GATABOX | GATA | 6 | 9 | 可能与光调节有关 | |
| IBOXCORE | GATAA | 2 | 2 | 光调控基因上游的保守序列 | |
| CIACADIANLELHC | CAANNNNATC | 0 | 2 | 昼夜节律表达所必需的区域 | |
| 激素响应元件 | ABREOSRAB21 | ACGTSSSC | 1 | 0 | ABA响应元件(ABRE) |
| ABRERATCAL | MACGYGB | 1 | 0 | ABRE相关序列 | |
| WBOXATNPR1 | TTGAC | 3 | 3 | 水杨酸(SA)诱导的WRKY DNA特异性识别结合蛋白 | |
| WRKY71OS | TGAC | 6 | 9 | 赤霉素信号通路的转录抑制因子 | |
| CATATGGMSAUR | CATATG | 1 | 0 | 参与生长素反应 | |
| CPBCSPOR | TATTAG | 3 | 0 | 体外增强细胞分裂素结合蛋白的关键序列 | |
| MYBGAHV | TAACAAA | 1 | 0 | 赤霉素响应元件 | |
| ARFAT | TGTCTC | 1 | 0 | ARF(生长素应答因子)结合位点 | |
| ERELEE4 | AWTTCAAA | 0 | 1 | ERE(乙烯反应元件) | |
| ACGTABREMOTIFA2OSEM | ACGTGKC | 0 | 1 | 脱落酸(ABA)响应元件 | |
| MYBATRD22 | CTAACCA | 0 | 1 | 参与ABA诱导 | |
| CATATGGMSAUR | CATATG | 0 | 1 | 参与生长素反应 | |
| 胁迫诱导和发 育相关元件 | MYB1AT | WAACCA | 1 | 0 | MYB识别位点,在脱水启动子中发现 |
| CBFHV | RYCGAC | 1 | 0 | 脱水反应元件 | |
| GT1GMSCAM4 | GAAAAA | 0 | 2 | 在盐诱导的SCaM-4基因表达中起作用 | |
| CRTDREHVCBF2 | GTCGAC | 1 | 0 | 核心CRT/DRE基序,DNA结合受温度调控 | |
| 转录因子 结合位点 | DOFCOREZM | AAAG | 16 | 14 | Dof蛋白结合所需要的核心位点 |
| CACGTGMOTIF | CACGTG | 1 | 0 | 拟南芥GBF4的结合位点 | |
| MYCCONSENSUSA | CANNTG | 4 | 6 | MYC识别位点 | |
| MYBCORE | CNGTTR | 1 | 2 | MYB结合位点 | |
| WBBOXPCWRKY1 | TTTGACY | 1 | 0 | WRKY1蛋白结合位点 | |
| CARGCW8GA | CWWWWWWWWG | 1 | 1 | AGL15的结合位点 | |
| MYB1A | WAACCA | 0 | 1 | MYB识别位点 | |
| MYB2CONSENSUS | YAACKG | 0 | 1 | MYB识别位点 | |
| ELRECOREPCRP1 | TTGACC | 0 | 1 | WRKY1蛋白结合位点 |
