欢迎访问《热带作物学报》,
生物技术与组织培养

基于SSR标记的68份红毛丹种质资源DNA指纹图谱构建

  • 林兴娥 1 ,
  • 牛俊海 2 ,
  • 陈莹 3 ,
  • 明建鸿 1 ,
  • 高宏茂 1 ,
  • 葛宇 1 ,
  • 周兆禧 , 1, *
展开
  • 1. 中国热带农业科学院海口实验站,海南海口 570102
  • 2. 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南儋州 571737
  • 3. 海南大学热带农林学院,海南儋州 571737
*周兆禧(ZHOU Zhaoxi),E-mail:

林兴娥(1981—),女,硕士,助理研究员,研究方向:热带果树种质资源收集、保存与评价。

收稿日期: 2018-06-27

  要求修回日期: 2019-02-13

  网络出版日期: 2019-05-21

基金资助

中国热带农业科学院基本科研业务费项目(No.1630092018004)

中国热带农业科学院基本科研业务费项目(No.1630092017010)

版权

版权所有,未经授权,不得转载、摘编本刊文章,不得使用本刊的版式设计。

Construction of DNA Fingerprinting with SSR Markers for 68 Rambutan (Nephelium lappaceum L.) Accessions

  • LIN Xing’e 1 ,
  • NIU Junhai 2 ,
  • CHEN Ying 3 ,
  • MING Jianhong 1 ,
  • GAO Hongmao 1 ,
  • GE Yu 1 ,
  • ZHOU Zhaoxi , 1, *
Expand
  • 1. Haikou Experimental Station, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 570102, China
  • 2. Tropical Crops Genetic Resources Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Danzhou, Hainan 571737, China
  • 3. Institute of Tropical Agriculture and Forestry, Hainan University, Danzhou, Hainan 571737, China

Received date: 2018-06-27

  Request revised date: 2019-02-13

  Online published: 2019-05-21

Copyright

Copyright reserved © 2019. Office of Acta Agronomica Sinica All articles published represent the opinions of the authors, and do not reflect the official policy of the Chinese Medical Association or the Editorial Board, unless this is clearly specified.

摘要

本研究利用筛选出的10对多态性高、条带清晰的SSR引物,以海南岛68份红毛丹种质为材料,进行遗传多样性分析和SSR指纹图谱的构建。结果表明:10对引物在供试材料中共检测出20个等位位点,多态性条带比例为100%,平均多态性信息含量(PIC)为0.393;对68份红毛丹种质做聚类分析,遗传相似系数为0.290~0.664;采用引物-带型组合法构建了68份红毛丹种质的指纹图谱。该结果为今后红毛丹种质鉴定和分子育种提供重要依据。

关键词: 红毛丹; SSR; DNA指纹图谱

本文引用格式

林兴娥 , 牛俊海 , 陈莹 , 明建鸿 , 高宏茂 , 葛宇 , 周兆禧 . 基于SSR标记的68份红毛丹种质资源DNA指纹图谱构建[J]. 热带作物学报, 2019 , 40(4) : 708 -714 . DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.04.013

Abstract

The SSR fingerprint map and genetic diversity of 68 rambutan (Nephelium lappaceum L.) accessions were studied using 10 pairs of selected polymorphic SSR primers. The results indicated that all the primers showed polymorphism, and 20 polymorphic alleles were revealed and the average polymorphic information content (PIC) was 0.393. The genetic similarities among accessions ranged from 0.290 to 0.664, on which a phylogenetic tree showing the relationship among the accessions was constructed. A strategy of combining primer pair with distinct alleles for fingerprint construction was developed and applied to the 68 cultivars. The DNA fingerprinting provides a technical reference for the varieties identification and molecular breeding in rambutan.

红毛丹(Nephelium lappaceum L.)为无患子科(Sapindaceae)韶子属(Nephelium)热带多年生常绿乔木植物,起源于印度尼西亚和马来半岛,别名毛荔枝,与荔枝、龙眼同科。海南保亭热带作物研究所(以下简称保亭热作所)自1960年从马来西亚引进我国试种,并在此基础上于20世纪80年代选育出适于海南省推广种植的‘保研’系列品系。早期对红毛丹品系缺乏系统完善的鉴定方法,传统的形态学特征鉴定易受环境条件影响,且资源圃内种植年限长,植株高大,挂果率低,以株型、叶型、果型等农艺性状和果实性状为主的鉴定方法难以实行,致使品系混乱,限制了有针对性地开展本土化育种,严重制约了我国红毛丹产业规模化、可持续性发展。
与传统的形态学标记方法相比,分子标记技术具有简便、可靠、不受环境影响和多态性高等优势。已有国外研究报道分别应用RAPD[1,2]、AFLP[3]、ISSR和SRAP[4]等通用型的DNA分子标记技术,对部分红毛丹品系开展了分子鉴定、种质资源评价等研究。但由于红毛丹基因组及遗传标记信息的匮乏,基于物种特异性分子标记(如SSR)的资源鉴定与评价尚未见报道。本研究在已完成红毛丹Genome survey测序及全基因组范围内开发SSR分子标记的基础上,筛选出10对高多态性SSR引物,对在海南岛收集并保存的68份红毛丹种质资源进行遗传多样性分析,并开发了一种指纹图谱构建方法,为红毛丹种质资源的亲缘关系分析、品种鉴定和分子育种等提供科学依据。

1 材料与方法

1.1 材料

66份红毛丹材料采自保亭热作所红毛丹种质资源圃,2份材料采自儋州热带植物园,基本信息如表1所示,采集枝条上无病虫害的新鲜幼嫩叶片,液氮速冻后-80 ℃保存备用。
表1 供试红毛丹种质信息

Tab. 1 The list of rambutan accessions

序号
No.
种质
Accessions
基础信息
Basic information
保存地
Locality
序号
No.
种质
Accessions
基础信息
Basic information
保存地
Locality
1 male 雄树、实生品系 保亭热作所 35 R27 不详 保亭热作所
2 BR2 黄果、实生品系 保亭热作所 36 R28 不详 保亭热作所
3 BR4 红果、实生品系 保亭热作所 37 R29 不详 保亭热作所
4 BR5 红果、实生品系 保亭热作所 38 R30 不详 保亭热作所
5 BR6 红果、实生品系 保亭热作所 39 R31 不详 保亭热作所
6 BR7 红果、实生品系 保亭热作所 40 R32 不详 保亭热作所
7 ZWY1 不详 儋州热带植物园 41 R33 不详 保亭热作所
8 ZWY2 不详 儋州热带植物园 42 R34 不详 保亭热作所
9 R1 不详 保亭热作所 43 R35 不详 保亭热作所
10 R2 不详 保亭热作所 44 R36 不详 保亭热作所
11 R3 不详 保亭热作所 45 R37 不详 保亭热作所
12 R4 不详 保亭热作所 46 R38 不详 保亭热作所
13 R5 不详 保亭热作所 47 R39 不详 保亭热作所
14 R6 不详 保亭热作所 48 R40 不详 保亭热作所
15 R7 不详 保亭热作所 49 R41 不详 保亭热作所
16 R8 不详 保亭热作所 50 R42 不详 保亭热作所
17 R9 不详 保亭热作所 51 R43 不详 保亭热作所
18 R10 不详 保亭热作所 52 R44 不详 保亭热作所
19 R11 不详 保亭热作所 53 R45 不详 保亭热作所
20 R12 不详 保亭热作所 54 R46 不详 保亭热作所
21 R13 不详 保亭热作所 55 R47 不详 保亭热作所
22 R14 不详 保亭热作所 56 R48 不详 保亭热作所
23 R15 不详 保亭热作所 57 R49 不详 保亭热作所
24 R16 不详 保亭热作所 58 R50 不详 保亭热作所
25 R17 不详 保亭热作所 59 R51 不详 保亭热作所
26 R18 不详 保亭热作所 60 R52 不详 保亭热作所
27 R19 不详 保亭热作所 61 R53 不详 保亭热作所
28 R20 不详 保亭热作所 62 R54 不详 保亭热作所
29 R21 不详 保亭热作所 63 R55 不详 保亭热作所
30 R22 不详 保亭热作所 64 R56 不详 保亭热作所
31 R23 不详 保亭热作所 65 R57 不详 保亭热作所
32 R24 不详 保亭热作所 66 R58 不详 保亭热作所
33 R25 不详 保亭热作所 67 R59 不详 保亭热作所
34 R26 不详 保亭热作所 68 R60 不详 保亭热作所

1.2 方法

1.2.1 红毛丹基因组DNA的提取及质量检测 采用改良2×CTAB法[5]提取红毛丹叶片基因组DNA。称取幼嫩叶片0.2 g,加入0.03 g PVP和液氮磨成细粉,然后转入2.0 mL预冷冻离心管中,再加入800 μL 65 ℃预热的CTAB提取液[2%(m/V)CTAB,100 mmol/L Tris-HCl,20 mmol/ L EDTA,1.4 mol/L NaCl,2%(m/V)PVP,pH调至8.0]和20 μL β-巯基乙醇充分混匀,65 ℃温浴30 min,期间轻摇2次;水浴完成后离心(15 ℃,12 000 r/min)15 min取上清液,加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提上清液,颠倒使之充分混匀,离心(4 ℃,12 000 r/min)15 min 取上清;再加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次,颠倒混匀,离心(4 ℃,12 000 r/min)15 min 取上清;加入等体积的异丙醇,混匀后可见丝状或絮状沉淀,即为DNA粗提物,用70%乙醇洗涤3遍,吹干;加入100 μL超纯水溶解DNA,再加入0.5 μL RNase A液(10 mg/mL),37 ℃水浴消化30 min,最后用紫外分光光度法和1%琼脂糖凝胶电泳法检测样品DNA质量及完整性。根据检测结果,将总DNA稀释至20 ng/μL后,-20 ℃保存待用。
1.2.2 分子标记分析 SSR引物均由深圳华大基因科技有限公司合成。从前期开发的红毛丹SSR标记中随机挑选出50对引物,以果皮颜色、果实大小和口感差异大的6份红毛丹种质DNA(分别为BR2、BR5、R2、R10、R20、R60)为模板进行PCR扩增,最后筛选出10对扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物(表2),SSR-PCR体系为20 μL,包括:30 ng DNA模板、0.2 mmol/L dNTPs、1.2 μmol/L引物,2.0 mmol/L MgCl2和2.0 U Taq DNA聚合酶。10×buffer、MgCl2Taq DNA聚合酶均购自Thermo Fisher Scientific公司。SSR-PCR反应程序为:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,60 ℃退火30 s,每个循环降1 ℃,72 ℃延伸1 min,共进行6个循环;94 ℃变性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共进行25个循环;72 ℃延伸5 min,10 ℃保存。PCR产物采用6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,恒功率60 W电泳1 h,银染显带。
表2 SSR引物信息

Tab. 2 SSR primers information

引物名称
Primer name
引物序列
Primer sequences(5°-3°)
重复单元
Repeat units
重复次数
Repeat number
退火温度
Annealing temperature/℃
目标片段大小
Expected length/bp
RamSSR5 CATATACAAAAGTTGCTGCGACA/TCCTACGACGAATTAGACAAACC TCAACG 4 59.552~60.197 133
RamSSR8 ACCAACTCTCAAACTGGAAGACA/AATTCGCAAAAGTGAAAGAGTTTT AATAAA 4 59.735~60.195 160
RamSSR12 CAAAAGCATCATGAATCAGCATA/ATGTGCCCATGTTCAAAAATAAA AAAAT 5 60.109~60.453 90
RamSSR13 CCATTAACAAACACAAAATAACTCG/AGAGAAACATTGAGGACAACGTC ATTTT 5 58.987~59.674 141
RamSSR19 GGGGAAGAGAAAAGGATACAATG/TTCCATGGTTCTACTATTCCACAA TTTTA 5 59.773~60.186 129
RamSSR25 GATTTCGAGTTTTCTTGGGATTT/AACAAGCAAAGAGAGTTGGTTTG ATAA 5 59.847~59.848 140
RamSSR27 AGCGTCGACTGGTACTAGAAGTG/AAAAGTTTTTGAGGAAGCCAAAG AGCA 4 60.013~60.145 118
RamSSR30 TTTTTCATGTCTCATGGTTTCAA/ATTTTGGATGAAGGTATGCTCAA TGTT 5 59.483~59.857 138
RamSSR31 AAGTTAGTTGTCTCCCCAAGTGA/AATCATCATCATCAATGCTTTCC CTTT 8 59.199~60.171 151
RamSSR33 CTGGCAATATTCCAACTATCCAT/CAGCTTGGTGTCATCTTTCATAC CATA 8 58.781~59.263 155

1.3 数据处理

根据电泳结果,在凝胶相同迁移率位置上,有条带的记为“1”,无条带的记为“0”,构成“0、1”序列数据阵,将图形资料转换为数字资料,采用Popgene 32软件进行多态性与特异性分析,使用NTSYS 2.0软件对种质进行UPGMA法聚类分析。DNA指纹图谱构建采用英文字母与数字组合的方式[6,7],其中英文字母按照多态引物字母编号依次排列,数字表示该分子标记在某样品上扩增条带的分子量,按分子量从大到小的顺序进行记录,同一引物扩增得到的不同条带间用“-”连接数字,综合不同引物的分析结果,串联各带型编号,形成该品种的SSR指纹图谱。

2 结果与分析

2.1 SSR标记多态性分析

对68份红毛丹种质进行PCR扩增,共检测到20条多态性片段,平均每个标记2条,多态性条带比例为100%。由表3可知,20对SSR标记检测到的有效等位基因(Ne)平均值为1.730,变幅为1.133(RamSSR25)~1.996(RamSSR19);每个标记的多态性信息含量(PIC)平均值为0.393,变幅为0.365(RamSSR13)~0.498(RamSSR19),由此可见,各品系间多态性较低。
表3 多态性SSR引物扩增结果及多态性信息

Tab. 3 Results and polymorphism information of SSR primers

引物
Primer
片段大小
Size range/bp
Na Ne PIC 引物编号
No. of primers
可鉴定材料数
No. of identification material
RamSSR5 130~140 2 1.987 0.369
RamSSR8 158~160 2 1.906 0.395
RamSSR12 140~150 2 1.682 0.374 A 6
RamSSR13 150~155 2 1.932 0.365 B 28
RamSSR19 138~140 2 1.996 0.498 C 13
RamSSR25 140~150 2 1.133 0.430 D 6
RamSSR27 138~140 2 1.195 0.374
RamSSR30 170~180 2 1.986 0.388 E 7
RamSSR31 151~155 2 1.682 0.366 F 6
RamSSR33 155~160 2 1.794 0.375 G 2
平均Mean 2 1.730 0.393

2.2 指纹图谱的构建

构建DNA指纹图谱的基本原则是利用尽量少的标记区分尽量多的种质,以达到提高检测效率、降低成本的目的。综合考虑引物扩增的条带数、稳定性、条带清晰度、PIC值等因素,最少用7对SSR引物(RamSSR12、RamSSR13、RamSSR19、RamSSR25、RamSSR30、RamSSR31、RamSSR33)就可将68份红毛丹种质完全区分(表4,图1)。其中,RamSSR13检测效率最高,可鉴别28份红毛丹种质。
表4 68份红毛丹种质SSR指纹图谱代码

Tab. 4 The SSR fingerprinting codes of 68 rambutan accessions

编号Code DNA数字指纹图谱 DNA fingerprint 编号Code DNA数字指纹图谱 DNA fingerprint
BR2 A140E180-170F155G160 R28 A140B155C138D150E170G160-155
BR4 A140B150E180-170F155G160 R29 A150-140B155C138D150E170F151G155
BR5 A140B155C140D150E170F155-151G160-155 R30 B155C138D150E170F151
BR6 A140B150-155C138-140D140E170F155G160 R31 C138D150E180F155-151
BR7 A150-140C140D150F155G160-155 R32 A150-140B150C138D150E170F155G160
ZWY1 B155D150E180-170G155 R33 A150-140C138D150E180F155-151G160
ZWY2 B150G155 R34 A150-140B150C138D150E170F155G160
R1 D150E180G160 R35 A150-140B155C138D150E170F151G160
R2 B150D140E180F155 R36 A150-140B150C138D150E180G160
R3 D140E170F155G155 R37 A150B155-150C138D150G160
R4 C138D150E180F155G160 R38 A140C140D150E180G160
R5 B150D150E180F155G155 R39 A140B155C138D150-140G160
R6 D150E170F155G155 R40 A140B150C140D150E180G160
R7 B155C140D150E180G155 R41 A140B155C140D150E180-170
R8 B150C140D150E180G160 R42 A140B155C140F155G160-155
R9 A140D150GE170G160 R43 A140B155-150D150E180-170F151G155
R10 B155D150E170F151G160 R44 A140B150C140F155G160
编号Code DNA数字指纹图谱 DNA fingerprint 编号Code DNA数字指纹图谱 DNA fingerprint
R11 A150-140B155C140D150E170G160 R45 A140B155-150C138D150F155G160
R12 A150-140C140D150G155 R46 A140C140E180-170F155G155
R13 B150E180-170F155G155 R47 A140B155C140F155-151G160-155
R14 B155D150E180-170G155 R48 A140B155-150C140F155G160
R15 A140B155C140E170G155 R49 A140B155-150E180F155G160
R16 A150-140B150C140D150E180 R50 A140B150C140-138D150E180F155G160
R17 A150B155C140D150F155-151G160 R51 A140B155C138D150E180F155G160
R18 A150-140D150E170F151G160 R52 A140B155-150D150F155-151G160
R19 A150-140B150D150E170G160 R53 A150-140B155C140D150E170F155G160
R20 A150B155C140D150E170F155G155 R54 A150-140D150E170F155G160
R21 A150-140B150C140D150E180G155 R55 A150-140B155D150E180F155-151G155
R22 A150-140B155C138D150F155 R56 A150-140B155C140D150E170F155-151G160
R23 A150-140B155C138D150F155G160 R57 A150-140B150C138D150E180-170F155G160
R24 A140B155D150E170F155G155 R58 A150-140C138D150F155-151G160
R25 A150-140C138D150F151G160 R59 A140B155C138D150F155-151G160
R26 D150G160 R60 A150-140C138E180F155G160
R27 A140C140D150G155 R61 F151G160
图1 RamSSR19引物对部分红毛丹种质的扩增电泳图

Fig. 1 Electrophoretic pattern of some rambutan cultivars (lines) with RamSSR19 primer

2.3 红毛丹种质资源的聚类分析

对68份红毛丹种质进行UPGMA法聚类分析,结果见图2。各品系间遗传相似系数平均值的变化范围为0.290~0.664,最小值变化范围为0~0.375,最大值的变化范围为0.572~1.000(表5)。由此可见,68份红毛丹种质间的平均遗传相似系数较低,整体上遗传多样性不高,但各种质间也有很明显的差异。ZWY2和BR2、R53,R24和R61遗传相似性系数均为0,说明ZWY2和BR2、R53,R24和R61遗传基础差异最大,R32和R34遗传相似系数为1,说明2个资源遗传基础相同,遗传来源接近。68份种质的聚类结果显示,在遗传相似系数为0.45处,所有品种可划分为4个类群,BR2为黄果实生苗,遗传基础和其他种质不同,每个类群又被分为几个亚群,总体遗传相似程度高,遗传多样性相对较低。
图2 基于遗传相似系数的68份种质的UPGMA聚类分析

Fig. 2 UPGMA dendrogram of 68 rambutan accessions based on genetic similarity coefficients

表5 68份红毛丹种质间的遗传相似系数

Tab. 5 The genetic similarity coefficient of 68 rambutan accessions

品系Accession 区间Range 平均值Mean 品系Accession 区间Range 平均值Mean
ZWY1 0.250~0.860 0.507 R28 0.133~0.670 0.503
ZWY2 0~0.670 0.290 R29 0.118~0.800 0.545
BR2 0~0.670 0.397 R30 0.143~0.842 0.495
BR4 0.270~0.818 0.595 R31 0.220~0.770 0.457
BR5 0.211~0.880 0.620 R32 0.200~0.762 0.509
BR6 0.240~0.810 0.549 R33 0.150~0.900 0.546
BR7 0.267~0.880 0.572 R34 0.200~1.000 0.527
R1 0.143~0.750 0.475 R35 0.118~0.909 0.569
R2 0.118~0.625 0.345 R36 0.250~0.820 0.558
R3 0.170~0.670 0.397 R37 0.250~0.800 0.546
R4 0.130~0.670 0.400 R38 0.220~0.800 0.520
R5 0.250~0.770 0.499 R39 0.130~0.800 0.536
R6 0.250~0.770 0.469 R40 0.270~0.889 0.559
R7 0.150~0.750 0.487 R41 0.170~0.800 0.571
R8 0.222~0.889 0.527 R42 0.235~0.778 0.459
R9 0.375~0.818 0.603 R43 0.270~0.740 0.549
R10 0.250~0.750 0.493 R44 0.130~0.780 0.475
R11 0.240~0.910 0.627 R45 0.330~0.857 0.560
R12 0.180~0.880 0.506 R46 0.118~0.770 0.463
R13 0.130~0.670 0.408 R47 0.310~0.950 0.483
R14 0.130~0.740 0.453 R48 0.240~0.947 0.518
R15 0.167~0.778 0.508 R49 0.240~0.900 0.529
R16 0.250~0.875 0.491 R50 0.270~0.820 0.561
R17 0.220~0.820 0.544 R51 0.170~0.860 0.595
R18 0.330~0.900 0.602 R52 0.330~0.800 0.580
R19 0.270~0.750 0.565 R53 0~0.800 0.507
R20 0.200~0.820 0.545 R54 0.308~0.572 0.577
R21 0.220~0.780 0.504 R55 0.170~0.860 0.566
R22 0.182~0.800 0.566 R56 0.140~0.910 0.611
R23 0.316~0.857 0.664 R57 0.290~0.960 0.581
R24 0~0.800 0.482 R58 0.170~0.860 0.545
R25 0.240~0.900 0.602 R59 0.150~0.860 0.590
R26 0.180~0.800 0.401 R60 0.170~0.857 0.513
R27 0.180~0.750 0.485 R61 0~0.800 0.381

3 讨论

随着分子生物学和基因组测序技术的发展,越来越多的分子标记被开发应用于植物遗传研究,SSR标记与ISSR、SRAP、RAPD等通用性分子标记相比,具有数量丰富、共显性遗传、多态性丰富等优点,现已广泛应用于果树的品种鉴定、遗传多样性研究等领域。Anggraheni等[2]利用6个RAPD标记对9个红毛丹品种进行了遗传多样性分析,多态性分析结果显示,品种间的变异率为56%,PIC值为0.2~0.5。Kuswandi等[8]对收集到的33份红毛丹及其近缘种质进行了形态学指标调查,并对其遗传多样性做了聚类分析,结果表明,红毛丹及其近缘种分布在不同类群中,平均变异率约为55%。本研究中利用7对SSR引物对68份红毛丹种质的聚类结果显示,在遗传相似系数为0.45处,所有种质可划分为4个类群 ,每个类群又被分为几个亚群(BR2为黄果实生苗,遗传基础和其他种质不同)。遗传相似性分析显示,68份红毛丹种质之间遗传相似系数平均值变幅为0.290~0.664,总体的遗传相似性较小,遗传基础相对较窄。
DNA 指纹图谱有助于快速、准确地鉴定品种真实性和纯度,已广泛应用于多种作物的遗传育种和品种保护研究中。其中SSR标记具备可重复性好、操作简便、共显性等优点,被认定是分子指纹图谱构建的可靠标记类型之一。本研究采用SSR引物-带型组合法构建的指纹图谱,筛选出7对SSR引物(RamSSR12、RamSSR13、RamSSR19、RamSSR25、RamSSR30、RamSSR31、RamSSR33)PIC值范围为0.362~0.498,平均PIC为0.399,略高于油菜(0.36)、花生(0.36)等作物指纹图谱构建所用的核心引物的PIC值[9,10],可将68份红毛丹种质完全区分。随着红毛丹种质收集数量的不断增加,需要不断筛选、增加引物,扩充指纹图谱数据库;同时,还可将形态学鉴定、同工酶遗传标记分析、染色体分析等技术结合起来,形成完整的红毛丹指纹图谱数据库,以保证指纹数据库的实用性和准确度。
本研究选用红毛丹种质资源大部分采自保亭热作所红毛丹种质资源圃,红毛丹种质均于20世纪60年代引自马来西亚等地区,由于年代久远,早期引种记录缺失,缺少配套栽培管理,导致红毛丹资源圃现有种质管理混乱,遗传基础不清晰,遗传多样性低。目前生产上主要种植‘保研7号’为主的‘保研’系列品种,由马来西亚种质选育,遗传基础相对狭窄,不仅果实商品类型不够丰富,也限制了遗传育种的潜力。因此,需要广泛收集和鉴定红毛丹种质资源,尤其是保护和挖掘本地的优异野生资源与开展品种改良工作,是扩大生产、降低风险、提高品质、促进我国红毛丹产业进一步发展的迫切需求。

The authors have declared that no competing interests exist.

作者已声明无竞争性利益关系。

[1]
Chew P C, Clyde M M, Normah M N , et al. Genetic diversity and relatedness among accessions of rambutan (Nephelium Lappaceum L.)[J]. Malaysian Applied Biology Journal, 2005,34(1):21-29.

[2]
Anggraheni Y G D, Mulyaningsih E S . Evaluation of nine Rambutan (Nephelium lappaceum) varieties genetic diversity using RAPD markers[J]. Biopropal Industri, 2018,9(1):1-8.

[3]
Andrade RAD, Wickert E, Martins ABG , et al. Genetic diversity among stock plants and progenies of rambutan[J]. Revista Brasileira de Fruticultura, 2012,34(2):630-634.

DOI

[4]
Christyne S N, Tatik C, Nina R D . Genetic diversity of wild rambutans (Nephelium spp.) in Sanggau, West Kalimantan based on SSR and ISSR markers[J]. Floribunda, 2016,5(4), 115-125.

[5]
林兴娥, 葛宇, 周兆禧 , 等. 一种高质量的红毛丹基因组DNA提取方法[J]. 热带农业科学, 2015,35(8):16-20.

[6]
范建光, 张海英, 宫国义 , 等. 西瓜DUS测试标准品种SSR指纹图谱构建及应用[J]. 植物遗传资源学报, 2013,14(5):892-899.

[7]
宋海斌, 崔喜波, 马鸿艳 , 等. 基于SSR标记的甜瓜品种(系)DNA指纹图谱库的构建[J]. 中国农业科学, 2012,45(13):2676-2689.

DOI

[8]
Kuswandi K, Sobir S, Suwarno W B . Genetic variation of rambutan germplasmin indonesia based on morphological characters[J]. Horticulture Journal, 2014,24(4):289-298.

[9]
许鲲, 李锋, 吴金锋 , 等. SSR荧光标记毛细管电泳法与国家冬油菜区试指纹鉴定平台的构建[J]. 中国油料作物学报, 2014,36(2):150-159.

DOI

[10]
任小平, 郑艳丽, 黄莉 , 等. 花生SSR核心引物筛选及育成品种DNA指纹图谱构建[J]. 中国油料作物学报, 2016,38(5):563-571.

DOI

文章导航

/